核小体结合的SOX2和SOX11结构阐明了先锋因子的作用
摘要
“先锋”转录因子是干细胞多能性、细胞分化和细胞重编程所必需的。先锋因子可与核小体DNA结合,这有利于染色质封闭基因组区域的基因表达。SOX2是胚胎干细胞多能性和自我更新所必需的重要先锋因子。本研究报告了SOX2的DNA结合域的低温电子显微镜结构,以及与核小体结合的密切同源SOX11。结构表明,SOX因子可以在超螺旋位置结合DNA并使局部DNA发生畸变。这些因素也促进了组蛋白八聚体末端核小体DNA的分离,从而增加了DNA的可达性。与核小体结合的SOX因子也可以使组蛋白H4的N端末端重新定位,该末端包括赖氨酸残基16。我们推测这种重新定位与高阶核小体堆叠不相容,后者涉及到组蛋白H4尾与邻近核小体的接触。我们的结果表明,先锋转录因子可以利用结合能启动染色质的开放,从而促进核小体的重构和后续的转录。
5. Nature揭示:Notch信号驱动滑膜成纤维细胞的识别和关节炎病理
Notch signalling drives synovial fibroblast identity and arthritis pathology
Kevin Wei, Michael B. Brenner 风湿病、炎症和免疫
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2222-z
摘要
滑膜是一种间充质组织,主要由成纤维细胞组成,在关节周围有一层膜和亚膜。类风湿性关节炎的滑膜组织明显增生,具有炎症和侵袭性,并破坏关节。最近的研究表明,在类风湿性关节炎中,有一部分成纤维细胞的亚群发生了显著的扩张,而这种扩张与疾病活性有关;然而,这些成纤维细胞分化和扩展的分子机制尚不清楚。本研究发现NOTCH3信号在表达CD90(由THY1编码)的血管周围成纤维细胞分化和次级成纤维细胞分化中起关键作用。利用单细胞RNA测序和滑膜组织类器官,我们发现NOTCH3信号驱动了成纤维细胞中从血管内皮细胞向外发散的转录梯度和空间梯度。在小鼠中,Notch3 基因的缺失或Notch3信号通路的阻断可减轻炎症并防止炎性关节炎中的关节损伤。我们的研究结果表明,滑膜成纤维细胞表现出一种由内皮源性Notch信号调节的位置特征,这种基质间的相互作用是炎性关节炎炎症和病理的基础。