摘要

保守酵母E3泛素连接酶Bre1及其伴侣E2泛素结合酶Rad6，在转录周期中在整个基因体中单泛素化组蛋白H2B。尽管进行型泛素化理论上可能来自于Bre1和Rad6与RNA聚合酶II2的传递，但H2B泛素化跨基因核小体的机制尚不清楚。本研究认为液-液相分离是潜在的机制。生化重构显示Bre1与支架蛋白Lge1结合，该蛋白具有一个本质上无序的区域，通过多价相互作用进行相分离。所得到的冷凝物包括被Bre1外部催化壳包裹的Lge1核心。这种层状液体吸收了Rad6和核小体底物，加速了H2B的泛素化。在体内，Lge1的凝聚形成区需要在+1核小体以外的基因体中泛素化H2B。我们的数据表明，组织修饰酶的分层冷凝物产生与染色质相关的“反应室”，增强了沿基因体的催化活性。同样的过程也可能发生在人体细胞中，并在受损时引起神经系统疾病。

10. Nature最新：与核小体结合的SWI/SNF染色质重塑蛋白RSC的结构

Structure of SWI/SNF chromatin remodeller RSC bound to a nucleosome

Felix R. Wagner, Patrick Cramer 生物物理化学

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2088-0

摘要

SWI/SNF家族的染色质重构复合物在核小体缺乏、转录活性启动子区域（NDRs）形成中发挥作用。酵母酵母中必不可少的SWI/SNF复合物RSC3包含16个亚基，包括ATP依赖性DNA转位酶Sth1。RSC从启动子区域去除核小体，并定位NDRs侧面的特殊的+1和- 1核小体。本研究给出了与核小体底物复合的RSC的低温电子显微结构。该结构揭示了RSC形成了5个蛋白质模块，并揭示了其重构机制的关键特征。人体模块充当四个灵活模块的支架，这四个模块我们称之为DNA相互作用、ATPase、arm和肌动蛋白相关（ARP）模块。DNA相互作用模块结合核外体DNA，并参与识别影响RSC功能的启动子DNA元素。ATPase和arm模块分别以Snf2 ATP偶联（SnAC）域和指螺旋结构将核小体盘夹在一起。ATPase模块的转位酶马达在超螺旋位置+2与核小体边缘接合。可移动的ARP模块可以调节转位酶-核小体相互作用来调节RSC活性。RSC核小体结构为理解NDR的形成以及在癌症中经常发生突变的人类SWI/SNF复合物的结构和功能提供了基础。